我院是国务院学位委员会首批确定的具有学士学位和硕士学位授予权的院校之一。我院前身为创建于1958年的芜湖医学专科学校。1974年经国务院批准，独立建院并命名为皖南医学院。长期以来，在上级的正确领导和大力支持下，经过几代皖医人的共同努力，学院不断发展壮大，已成为一所较为完备的高等医学本科院校。
我院设有临床医学、法医学、口腔医学等10个本科专业及药学等7个专科专业。研究生教育设有药理学、生理学、内科学等14个硕士学位授权点，基本涵盖了基础医学及临床医学各学科。校园占地面积705亩。现有全日制在校生6396人，其中硕士研究生193人；本科5735人；专科468人。
有定量药理、细胞电生理、生殖医学、中医文献等9个研究所（室）及机能学实验中心、形态学实验中心等7个实验中心，并设电化教学中心和计算机网络中心。我院在定量药理、细胞电生理、生殖医学等研究领域在国内具有一定优势和特色。有多项科研成果获得省、部、国家级奖励，其中有些项目的研究达到国内先进水平。
学院现有教职医护员工近1800人，其中教授、主任医师83人，副教授、副主任医师216人。近年来先后有15人荣获国家和省级优秀教师或有突出贡献的中青年专家，42位专家享受政府特殊津贴，9人为省中青年学科带头人培养对象，6人为省跨世纪学术和技术带头人，13人为省中青年骨干教师。
