1956年7月14日游人在宏觉寺塔底层发现地宫，地宫上园下方，藏有文物，经南京博物院派人发掘，清理出鎏金喇嘛塔一座，塔高0.35米，须弥座高0.16米，塔底刻有“金陵牛首山弘觉禅寺永充供养”和“佛弟子御用监太监李福善奉施”题记。塔身有四个门，佛龛有释迦、韦陀佛象。塔刹上置相轮十三天、宝盖、葫芦宝顶。同时出土的还有佛象、玉瓶等文物。后来，南京市文物保管委员会派人对砖塔塔壁上题记进行了调查，发现了七十余条明清两代游人题记。时隔30余年，1991年9月市文管会力修塔搭架对塔进行上面测绘与调查，这些题记仍保存完好，它们都是明刀或瓷片在门券洞壁的石灰粉刷层上刻划的，分布在3—7层，年代从明正德五年（1501年）到乾隆三十二：年（1767年）。最多为明嘉靖、万历与清康熙年间。说明这段时间寺庙香炎最盛，游人最多。同时还告诉我们，宏觉寺增重修或重建是在明正德五年（1510年）前，最后遭破坏是在清乾隆年间。从木结构的受损来看，宏觉寺塔似乎遭受雷击，大火从塔顶烧到底层，塔内的各层楼板、塔心木，塔外围的平座栏杆，腰檐、内外斗拱，底层附阶所有木结构部分都不存在。它的砖石结构保存尚完整。