孔子博物馆位于曲阜市中心，曲阜的标志性大街大成路（又称“华灯街”）中段，距汽车站仅200米，距孔庙仅300米，与市委市政府机关大院一河之隔，与杏坛剧场、论语碑苑隔路相望。
孔子博物馆是由国务院批准建设，江泽民同志题写院名，吴良镛先生主持设计的大型文化工程，具有旅游观光、博物馆展览、文献收藏、学术研究、信息交流和人才培训等功能，同时又是仿古建筑的又一杰作。
园区总体布局借鉴“河图”、“洛书”和“九宫”观念以及中国传统风光学说的积极因素，融合“礼”、“和”等儒家理念建筑，园林巧妙配置，明堂、辟雍、书院有机结合，书法、绘画、雕塑和谐装饰，充分体现了象征性、纪念性、民族性、时代性，成为优秀的纪念性建筑。
