与大陆深圳隔河相望，同时也是香港最大的自然保护区，于1995年正式列入国际重要湿地名录，成为我国第七个加入国际萨姆尔公约的重要湿地。
早在1976年，香港政府就为了保护米埔湿地而划设禁猎区，甚至从1980年代开始以一个基围塘80万港币的高额回馈金买回原有的土地权，到了1990年米埔保护区土地全数收回，并交由世界野生动物香港基金会管理，现在政府每年还资助超过100万的港币来协助保护区运行，虽然一年最多只开放4万人左右参观。
香港自1976年始，在城市周围因地制宜，把原始山林或湿地开辟郊野公园或自然保护区，数目已有21个之多。
它们不仅保护了4万多公顷郊野环境，成了不少香港残存的野生动物的自然庇护所，而且也让这个日渐哮喘的城市，增强了肾或肺功能。
米埔自然保护区根据环境容量，实施严格的准入制度，该保护区核定全年的游客数量是3万人，一个星期中，周一、周二、周四、周五是学生接待日，周末是香港公众接待日，星期三是保护区内部事务处理的日子。
世界自然基金会自1984年起就开始了和香港渔农署的合作，进行香港自然保护区的管理和保护工作。具体说来，由渔农署核发“进入自然保护区准许证”，由世界自然基金会（香港分会）负责保护区的日常管理、教育培训和项目开展，这么算来，基金会和香港政府渔农署已经有了超过20年朝夕相处的合作。根据香港法令第170章即《野生动物保护》制定的“未经批准擅自进入自然保护区罚款5万元”的招牌，就醒目地立在米埔自然保护区窄窄的准入通道前。
香港米埔自然保护区虽然只有380公顷，但作为西伯利亚候鸟飞往澳大利亚之间最后一个陆地，有着丰富的动植物资源，其中脊椎动物多达400多种，后海湾冬季候鸟5.8万多只。正因为如此，香港政府1976年就宣布米埔是一个“具有特别科学价值的地区”，1978年起开始限量控制香港居民进入该区域，并且在长达20年的时间里，开始有计划地居民迁移。1995年米埔自然保护区正式列入国际重要湿地保护名录，基于此，米埔自然保护区的宗旨是“国际湿地的保护和环境教育”，香港政府和世界自然基金会严格遵循这一准则。
在香港这个真正寸土寸金的地方，面积380公顷的自然保护区每年核定的由世界自然基金会交给香港特区政府的土地租金其实只有象征性的一元钱，而一次违法进入的罚款却高达5万元，由此可见香港政府对保护自然生境的高度重视了。而渔农署和世界自然基金会（香港分会），也牢固坚持“国际湿地的保护和环境教育”的宗旨，没有利用该区域强大的经济优势发展生态旅游，始终坚持生态与环境保护放在第一位，同时建立了极具操作性和科学性的管理体系，如及时、定量清除区内植物以保证野生动物的食物供应、筑巢等，基围和池塘水位管理则根据不同鸟类的食物的要求，控制不同的水位标准。
而米埔自然保护区最核心的红树林同时也是中国最大一片红树林在管理方面尤其严格，除了科学考察和环境教育外，几乎控制了游人的进入，为了有效地保护这片红树林，米埔自然保护区别出心裁地架设了一条长1500米的浮桥，这条浮桥可以随水位涨落而变化，既避免了对红树林的砍伐，同时也方便科学人员及时跟踪红树林的变化
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