博物馆分设地方史文物陈列、内蒙古敖汉辽墓壁画文物精品展、内蒙古古代岩画陈列、稀土馆和《包头五十年》成就展览。其中内蒙古古代岩画和稀土展览都在国内独具特色。
包头博物馆现设有:包头地方史文物陈列;藏传佛教唐喀艺术展;内蒙古古代岩画陈列;稀土馆和“包头五十年”成就展。其中内蒙古古代岩画陈列获年度全国文物系统“十大陈列展览精品”奖;稀土馆开馆被列为1999年度“中国稀土十件大事”之一。博物馆的基本陈列入选内蒙古自治区五十年来“十大陈列展览精品”。
包头博物馆现有历史文物2216件,其中一级文物5件,二、三级文物40件,钱币十万多枚,科技文物448件,其中不乏精品和珍贵价值的文献、标本。